1.水源：（反滲透及蒸餾水系統）需使用普通城市自來水作為供水。

2.電源：純水機應該安裝在電源穩定的場所。如果電源不穩定，可能對系統功能造成不利影響，嚴重時可能會燒毀系統主板。

3.純水機安裝場地：應該安裝在盡可能潔凈的實驗室，以確保其超純水產水不被二次污染。安裝場地需要適當接近上、下水管道，并且要保持安裝點的通風、干燥，避免陽光直接照射。

4.維護：用戶應按照廠家工程師和純水機本身的提示定期更換純化柱，并留意系統的報警提示。并根據用戶手冊的要求與服務工程師聯系。

純水系統日常使用時，應盡可能的持續使用，保持電源和水源的正常供應。但是，由于特殊原因純水系統不得不長時間停止使用時，可以參考以下方法：

如果因為實驗室整修或是長時間休息，造成純水、長期停用時，為了將來可以使實驗正常進行，必須施行一定的應對措施。

若停用期為1星期到10天，且電源及水源不受影響，就可以讓系統保持運作狀態，就能繼續獲得安定的純化水質。若是進行水管工程，則系統一定要完全停止。這時候應關閉純水系統的供水開關與電源，并拆卸與供應水之間的連接。而水箱中的純水，由于長時間靜置將造成水質的劣化，因此要完全排空。

停用期結束后，如再度使用系統時應注意，尤其是水管工程修復后，由于供給水中會混有許多的污染物質，因此，應先將供水來源的水龍頭打開充分排水使水質穩定后，再打開與系統相連結的進水開關，來啟動系統。此一程序可以防止大量的污染物質流入系統之中。

如果采取前述對策后系統仍不能正常的運作，這可能是停用期間純化柱與濾膜受到阻塞所引起的。因此，應將有問題的部分加以更換。

純水系統取水時，應注意避免被二次污染。尤其是超純水系統地產水極易被污染，所以，取用超純水時，應該做到即取即用，避免儲存。

及時更換低成本的預處理柱是降低使用成本的方法。對于超純水系統而言，可以通過定期的校驗系統內置的電阻率監測器，確保電阻率的讀數正確，并根據電阻率監測器的數據和超純化柱的使用時間（一般不超過2年）來決定是否更換超純化柱。